Le Palais est appelé Nouveau parce qu'il a été construit de toutes pièces, sur la base du projet de Michel-Ange, pour compléter la conception de la place du Capitole, en plus du Palazzo Senatorio et du Palazzo dei Conservatori préexistants. Le musée a été inauguré en 1734, sous le pontificat de Clément XII, qui avait acheté l'année précédente la très importante collection d'antiquités albanaises, composée de 418 sculptures, pour les collections du Capitole. Celles-ci s'ajoutent aux œuvres déjà exposées au Belvédère du Vatican et données au Capitole par le pape Pie V en 1566, ainsi qu'aux sculptures qui, année après année, arrivaient sur la colline et qui ne trouvaient plus de place dans le Palais des Conservateurs. .